Nova Patents
HUT57263A

Process for producing bacterial vectors

Abstract

This record has no abstract on file.

HUT57263A, drawing sheet 1
Sheet 1 of 33

Term

No projected expiry on record.

  1. Priority
  2. Filed
  3. Published
  4. Today

39 claims: 4 independent, 35 dependent

  1. 1
    I génypontok 1. Eljárás hibrid vektorok előállítására, amely vektorok a) a pUCRS plazmid kb. 3,5 kbp méretű, Lactococcus lactis eredetű EcoRI/Sall inzertjét vagy annak egy funkcionális fragmentumát, vagy b) a fenti inzerttel vagy annak egy funkcionális fragmentumával hibridizálődni képes DSN-szekvenciát, vagy a hibridizálódó DNS-szekvenciával természetes módon, működőképesen kapcsolódó promoter-szakaszt, vagy c) az a) vagy b) pontnak megfelelő, degenerált DNS-szekvenciát, amely egy jelző pepiidet kódol, vagy d) egy DNS-molekula a), b) vagy c) pontnak megfelelő származékát , és/vagy e) (I) a L. lactis LL712 2,5 Md molekulatömegű plazmidjának vagy (II) a L. lactis LL712 5,2 Md molekulatömegű plazmidjának, vagy (III) a L. lactis LL712 2,5 Md-os vagy 5,2 Md-os plazmidjaival azonos inkompatibilitási csoportba tartozó plazmádnak a replikációs kezdőhelyét tartalmazzák , eljárás magába foglalja egy ilyen hibrid vektort hordozó gazdaszervezet tenyésztését és a hibrid vektor izolálását a tenyésztett gazdaszervezetből, vagy ame A) • · · · · · • · · · · · · ·«· ···· · • ···· · · ·· · ··· · ···· ·· · · - 71 B) egy ilyen hibrid vektor előállítását in vitro szintézissé 1 .
  2. 2
    Az 1. igénypont szerinti eljárás olyan hibrid vektor előállítására, amely a pUCRS plazmid mintegy 3,5 kbp hosszúságú, L. lactis eredetű EcoRI/Sall inzertjét vagy annak egy funkcionális fragmentumát hordozza.
  3. 3
    Az 1. igénypont szerinti eljárás olyan hibrid vektor előállítására, amelyben a funkcionális fragmentum megőrzi az MSP promoter-, jelző peptid- és/vagy struktúrgén-funkciót.
  4. 4
    A 3. igénypont szerinti eljárás olyan hibrid vektor előállítására, amelyben a funkcionális fragmentum az MSP promoter-funkciót Őrzi meg.
  5. 5
    A 4. igénypont szerinti eljárás olyan hibrid vektor előállítására, amelyben a promoter-funkciőt megőrző funkcionális fragmentum a pre-MSP szekvencia startkodonjátó1 az MSP-gén mintegy -1500. pozíciójú bázisáig terjed.
  6. 6
    Az 5. igénypont szerinti eljárás olyan hibrid vektor előállítására, amelyben a promoter-funkciőt megőrző funkcionális fragmentum a pre-MSP szekvencia startkodonjától az MSP-gén -100. — -1000. közötti pozíciójú bázisáig terjed.
  7. 7
    A 3. igénypont szerinti eljárás olyan hibrid vektor előállítására, amelyben a funkcionális fragmentum az MSP jelző peptid funkciót őrzi meg. • · · ·
  8. 8
    A 7. igénypont szerinti eljárás olyan hibrid vektor elÖa'l látására, amelyben az MSP jelző peptid funkciót megőrző funkcionális fragmentum a 27 aminosav hosszúságú MSP jelző peptid kódoló szekvenciája.
  9. 9
    A 7. igénypont szerinti eljárás olyan hibrid vektor előállítására, amelyben az MSP jelző peptid funkciót megőrző funkcionális fragmentum a SEQ ID No. 1. DNS-szekvencia 411. bázisától a 491. bázisáig terjed.
  10. 10
    A 3. igénypont szerinti eljárás olyan hibrid vektor előállítására, amelyben a funkcionális fragmentum az MSP promoter-funkcióját és jelző peptid funkcióját őrzi meg.
  11. 11
    A 10. igénypont szerinti eljárás olyan hibrid vektor előállítására, amelyben az MSP promoter-funkcióját és jelző peptid funkcióját megőrző funkcionális fragmentum azon fragmentumok egyike, amelyek a pUCRS plazmid mintegy 3,5 kbp hosszúságú, L. lactis eredetű EcoRI/Sall inzertjének EcoRI-vége és a SEQ ID No. 1 1. bázisától felfelé elhelyezkedő első HindlII restrikciós helye közötti bármely bázis és a SEQ ID. No. 1 491. bázisa között helyezkednek el.
  12. 12
    A 3. igénypont szerinti eljárás olyan hibrid vektor előállítására, amelyben a funkcionális fragmentum az MSP struktúrgén-funkcióját őrzi meg.
  13. 13
    A 12. igénypont szerinti eljárás olyan hibrid vektor előállítására, amelyben az MSP struktúrgén-funkciót megőrző t - 73 í funkcionális fragmentum a SEQ ID No. 1 DNS-szekvencia 492. I bázisától az 1793. bázisáig terjed.
  14. 14
    Άζ 1. igénypont szerinti eljárás az olyan, 1. igénypont sze- I rinti hibrid vektorok előállítására, amelyek egy, a pUCRS plazmid mintegy 3,5 kbp hosszúságú L. lactis eredetű EcoRI/ i | Sáli inzertjével vagy annak egy funkcionális fragmentumával I hibridizálddni képes DNS-szekvenciát vagy egy ilyen hibridii | zálódó szekvenciát és egy azzal működőképesen kapcsolt promoI | ter-szakaszt tartalmaznak. I
  15. 15
    A 14. igénypont szerinti eljárás olyan hibrid vektor előállí| tására, amely egy, az MSP génjéhez hasonló gént kódoló DNSI -szekvenciát vagy annak egy funkcionális fragmentumát vagy egy, az MSP génjéhez hasonló gén promoter-szakaszát hordozza.
  16. 16
    Az 1. igénypont szerinti eljárás olyan hibrid vektor előállítására, amely az MSP jelző peptidjét vagy egy hasonló pepiidet kódoló DNS-szekvenciát hordoz, amelynek genetikai kódja j degenerált egy la) vagy lb) igénypont szerinti DNS-szekvenci! ához képest. i
  17. 17
    Az 1. igénypont szerinti eljárás olyan hibrid vektor előállí- tására, amely egy la), lb) vagy le) szerinti DNS-molekula egy ! származékát hordozza. j
  18. 18
    Az 1. igénypont szerinti eljárás olyan hibrid vektor elŐállí 1 tására, amely (I) a L. lactis 712 2,5 Md molekulatömegű plazi midjának, vagy (II) a L. lactis 712 5,2 Md mo1eku1atömegű plazmidjának, vagy (III) egy, a L. lactis 2,5 Md-os vagy 5,2 Md-os ρ1azmidjaiva1 azonos inkompatibilitási csoportba tartozó plazmidnak a replikációs kezdőhelyét tartalmazza.
  19. 19
    A 18. igénypont szerinti eljárás olyan hibrid vektor előállítására, amely a L. lactis 2,5 Md-os plazmidjának a mintegy 1,8 kbp hosszúságú Ndel/Sphl fragmentumán elhelyezkedő replikációs kezdőhelyet tartalmazza.
  20. 20
    A 18. igénypont szerinti eljárás olyan hibrid vektor előállítására, amely a L. lactis 5,'2 Md-os plazmidjának a mintegy 1,0 kbp hosszúságú Ndel/HindlII fragmentumán elhelyezkedő replikációs kezelőhelyet tartalmazza.
  21. 21
    Az 1. igénypont szerinti eljárás olyan hibrid vektor előállítására, amely a pUCRS, pSC12, pSC12deltaP, pSC12deltaN, pSC12deltaNP, pSC18, pSC18deltaP vagy pSC18deltaN, PSC12HIR, PSC12HIR-1, pSC12HIRTerm, M13mpl8RS, M13mpl9H, pVAHIR-1 és pVAHIR plazmidok alkotta csoportba tartozik.
  22. 22
    Az 1. igénypont szerinti eljárás a pSC12HIRTerm plazmid. előáll ítására.
  23. 23
    Az 1. igénypont szerinti eljárás olyan hibrid vektor előállítására, amely egy, az MSP jelző peptidjét kódoló DNS-szekvenciával és az MSP promoter-szakaszáva1 vagy egy heterológ promoterrel egységes leolvasási keretbe foglalt homológ vagy heterológ struktúrgént hordoz.
  24. 24
    Eljárás olyan DNS-molekula előállítására, amely I a) a pUCRS plazmid. kb. 3,5 kbp hosszúságú, L. lactis eredetű EcoRI/Sall inzertje vagy annak egy funkcionális fragmentuma, vagy b) hibridizálódni képes a fenti inzerttel vagy annak egy funkcionális fragmentumával, vagy egy olyan promoter-szakaszt tartalmaz, amely természetes módon, működőképesen kapcsolódik egy ilyen hibridizálódó szekvenciához, vagy c) egy, az a) vagy b) pontnak megfelelő, egy jelző peptidet kódoló DNS-szekvencia degenerált változata, vagy d) egy, az a), b) vagy c) pontnak megfelelő DNS-molekula származéka, és/vagy e) (I) a L. lactis LL712 2,5 Md molekulatömegü plazmidjának, vagy (II) a L. lactis LL712 5,2 Md molekulatömegü ρ1azmidjának, vagy (III) egy, a L. lactis LL712 2,5 Mdos vagy 5,2 Md-os plazmidjáival azonos inkompatibilitási csoportba tartozó plazmid replikációs kezdőhelyét tartalmazza , amely eljárás magába foglalja A) egy ilyen DNS-molekulát hordozó gazdaszervezet tenyésztését és a DNS-molekula izolálását a tenyésztett gazdaszervezetből , vagy B) egy ilyen DNS-molekula előállítását in vitro szintézis- sé 1 .
  25. 25
    Eljárás egy, az 1. igénypont szerinti eljárással előállított hibrid vektorral transzformált gazdaszervezet létrehozására, amely eljárás magába foglalja (a) egy gazdaszervezet transzformációt elősegítő körülmények között történő kezelését egy 1. igénypont szerinti eljárással előállított hibrid vektorral, előnyösen egy szelekciós marker-génne1 együtt, és (b) a transzformánsok szelekcióját.
  26. 26
    A 25. igénypont szerinti eljárás olyan transzformált gazdaszervezet létrehozására, amely a pUCRS, pSC12, pSC12deltaP, pSC12deltaN, pSC12deltaNP, pSC18, pSC18deltaN, pSC18deltaP, pSC12HIR, pSC12HIR-l vagy pSC12HIRTerm plazmidokkal transzformált Escherichia coli TG1, C600 és HB101, vagy a pUCRS, PSC12, pSC12deltaP, pSC12deltaN, pSCl2de1taNP, pSC18, pSC18deltaN, pSC18deltaP, pVAHIR, pVAHIR-Ι, PSC12HIR, PSC12HIR-1 vagy pSC12HIRTerm plazmidokkal transzformált Lactococcus cremoris, ρ1azmidmentes Lactococcus lactis törzsek és egy Baci1lus-törzs alkotta csoportba tartozik.
  27. 27
    A 25. igénypont szerinti eljárás olyan transzformált gazdaszervezet létrehozására, amely a pUCRS plazmiddal transzformált Escherichia coli TG1, a pUCRS, pSC12HIRTerm, pSC12 vagy pSC18 plazmidokkal transzformált Lactococcus lactis és a pVAHIR vagy pVAHIR-Ι plazmidokkal transzformált Bacillus thuringiensis alkotta csoportba tartozik. '•e·' * · ·· ···
  28. 28
    Eljárás polipeptidek előállítására, amely eljárás magába foglalja (a) egy homológ vagy heterológ struktúrgén és egy, az MSP jelző peptidjét kódoló DNS-szekvencia egy egységes leolvasási keretbe foglalását, (b) egy megfelelő gazdaszervezet transzformálását egy, a fúziós gént hordozó, az (a) pont szerint előállított hibrid vektorral, (c) a fúziós gén által kódolt polipeptid kiválasztatását a gazdasejttel, és —kívánt esetben— (d) a polipeptid szokásos módszerekkel történő kinyerését a gazdasejtek tápfolyadékából.
  29. 29
    A 28. igénypont szerinti eljárás, amelyben a gazdaszervezet a Lactococcus- és Baci11us-fajók alkotta csoportba tartozik.
  30. 30
    A 28. igénypont szerinti eljárás, amelyben olyan baktériumot használunk gazdaszervezetként, amely nem választ ki a tápfolyadékba egy, a szekretált fehérjét lebontó proteázt.
  31. 31
    A 28. igénypont szerinti eljárás, amellyel deszulfo-hirudint termelünk. '
  32. 32
    A 31. igénypont szerinti eljárás, amelyben pSC12HIR, | PSC12HIR-1 vagy pSC12HIRTerm plazmáddal transzformált LactoL coccus lactis LM0230 sejteket használunk. i I
  33. 33
    A 31. igénypont szerinti eljárás, amelyben pSC12HIRTerm plazmáddal transzformált Lactococcus lactis LM0230 sejteket használunk .
  34. 34
    A 31. igénypont szerinti eljárás, amelyben pVAHIR vagy pVAHIR-1 plazmáddal transzformált Bacillus thuringiensis tf «··· 9 ·» « *·* sejteket használunk.
  35. 35
    Ά 28. igénypont szerinti eljárás azzal jellemezve, hogy (a) a transzformált sejteket vagy a lóg- vagy a stacioner fázisban kinyerjük a tenyészetből, (b) kisebb térfogatú tápfolyadékban vagy megfelelő pufferben fe1szuszpendá1juk és (c) tovább inkubáljuk azokat a kívánt terméknek a tenyészet felülúszójából való kinyerése előtt.
  36. 36
    A 35. igénypont szerinti eljárás azzal jellemezve, hogy a transzformált sejteket az etédeti tenyészet térfogatának 1 20 %-ában szuszpendá1juk fel.
  37. 37
    A 36. igénypont szerinti eljárás azzal jellemezve, hogy a pSC12HIRTerm plazmiddal transzformált Lactococcus lactis LM0230 sejteket 1/10 térfogatnyi friss tápfolyadékban felszuszpendá1va még 30 percen át inkubáljuk 30 °C hőmérsékleten .
  38. 38
    A 28. igénypont szerinti eljárás, amelyben MSP-t állítunk elő.
  39. 39
    Eljárás tiszta MSP előállítására, amely eljárás magába foglalja (a) a Lactococcus lactis LM0230 tenyészete felülúszójának triklór-ecetsavas kicsapását, (b) a kicsapott fehérjék SDS-po1akri1 amid gélelektroforézissel történő elválasztását, (c) a legnagyobb fehérje-sáv kivágását és (d) az MSP elektroelúcióval történő kivonását a gélből.
Independent claims39