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MX348166B

Covalent diabodies and uses thereof.

Abstract

The present invention relates to diabody molecules and their uses in the treatment of a variety of diseases and disorders, including immunological disorders, infectious disease, intoxication, and cancers. The diabody molecules of the invention comprise two polypeptide chains that associate to form at least two epitope binding sites, which can recognize the same or different epitopes on the same or different antigens. Additionally, the antigens can form the same or different molecules. The individual polypeptide chains of the diabody molecule can be covalently linked through non-peptide-binding covalent bonds, such as, but not limited to, the disulfide bond of cysteine ​​residues located within each polypeptide chain. In partial modalities,

MX348166B, drawing sheet 1
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  1. 1
    Habiéndose descrito la invención como antecede, se reclama como propiedad lo contenido en las siguientes reivindicaciones:1. Una molécula de diacuerpo que comprende una primera cadena de polipéptidos y una segunda cadena de polipéptidos, las cadenas de polipéptidos están unidas covalentemente entre sí, caracterizada porque: I. la primera cadena de polipéptidos comprende, en la dirección N-terminal a C-terminal: (i) un primer dominio que comprende una región de unión de un dominio variable de cadena ligera de una primera inmunoglobulina (VL1) específica para un epítopo (1), (ii) un segundo dominio que comprende una región de unión de un dominio variable de cadena pesada de una segunda inmunoglobulina (VH2) específica para un epítopo (2) , y (iii) un dominio de polipéptido cargado positiva o negativamente que de manera espontánea adquiere una conformación helicoidal;primer dominio y segundo dominios los cuales están unidos covalentemente de manera que el primer dominio y el segundo dominio no se asocian juntos para formar el epítopo (1) de sitio de unión o el epítopo (2) de sitio de unión;II. la segunda cadena de polipéptidos comprende, en la dirección N-terminal a C-terminal: (i) un cuarto dominio que comprende una región de unión de un dominio - IMPI^ msxicaw ' nt LA morí £LA Γ iNrMisn»!*, variable de cadena ligera de una segunda inmunoglobulina (VL2) específica para el epítopo (2) , (ii) un quinto dominio que comprende una región de unión de un dominio variable de cadena pesada de la primera inmunoglobulina (VH1) específico para el epítopo (1);cuarto dominio y quinto dominio los cuales están unidos covalentemente de manera que el cuarto dominio y quinto dominio no se asocian juntos para formar el sitio de unión de epítopo (1) o el sitio de unión de epítopo (2);en donde el primer dominio y el quinto dominio se asocian juntos para formar un sitio de unión (VL1)(VH1) que unen al epítopo (1);en donde el segundo dominio y el cuarto dominio se asocian juntos para formar un sitio de unión (VL2)(VH2) que unen al epítopo (2).
  2. 2
    La molécula de diacuerpo de conformidad con la reivindicación 1, caracterizada porque la segunda cadena de polipéptidos comprende adicionalmente:(iii) un dominio de polipéptido cargado negativa o positivamente que de manera espontánea adquiere una conformación helicoidal unida a un quinto dominio, en donde uno de la primera y segunda cadenas de polipéptidos contienen el dominio de polipéptido cargado positivamente que de manera espontánea adquiere una conformación helicoidal y la otra de la primera y segunda cadenas de polipéptidos que contiene el dominio de - 475 - IMPIOS ι·ςτπντο mexican. ’ Μ ΙΑ PS0FÍLOAI IN'MISTSIAI. -7--polipéptido cargado negativamente espontáneamente .asumft-jma».— conformación helicoidal.
  3. 3
    La molécula de diacuerpo de conformidad con la reivindicación 1 ó 2, caracterizada porque la primera cadena de polipéptido adicionalmente comprende un tercer dominio, el tercer dominio está separado del segundo dominio por el dominio de polipéptido cargado, en donde el tercer dominio es un dominio Fe o una porción del mismo.
  4. 4
    La molécula de diacuerpo de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, caracterizada porque la segunda cadena de polipéptido comprende adicionalmente un sexto dominio, el sexto dominio está separado del quinto dominio por el dominio de polipéptido cargado, en donde el sexto dominio es un dominio Fe o una porción del mismo.
  5. 5
    La molécula de diacuerpo de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, caracterizada porque el diacuerpo adicionalmente comprende una tercera cadena de polipéptido y una carta cadena de polipéptido, la tercera y cuarta cadenas de polipéptidos están unidas covalentemente entre sí, en donde:III. la tercera cadena de polipéptidos comprende, en la dirección N-terminal a C-terminal: (i) un séptimo dominio que comprende una región de unión de un dominio variable de cadena ligera de una tercera inmunoglobulina - 476 IMPI iwsTiivnj Μβχκ Ν DE IA. MOFIEDaC iNnurntiAi (VL3) específica para un epítopo (3) , (ii) un octavo dominio que comprende una región de unión de un dominio variable de cadena pesada de una cuarta inmunoglobulina (VH4) específica para un epítopo (4), (iii) un dominio de polipéptido cargado positiva o negativamente que de manera espontánea adquiere una conformación helicoidal, y (iv) un noveno dominio en donde el noveno dominio es un dominio Fe o una porción del mismo;séptimo dominio y octavo dominios los cuales están unidos covalentemente de manera que el séptimo dominio y el octavo dominio no se asocian juntos para formar el sitio de unión a epítopo (3) o el sitio de unión a epítopo (4);IV. la cuarta cadena de polipéptidos comprende, en la dirección N-terminal a C-terminal: (i) un décimo dominio que comprende una región de unión o un dominio variable de cadena ligera de la cuarta inmunoglobulina (VL4) específica para el epítopo (4), (ii) un décimo primer dominio que comprende una región de unión de un dominio variable de cadena pesada de la tercera inmunoglobulina (VH3) específico para el epítopo (3);décimo dominio y décimo primer dominios los cuales están unidos covalentemente de manera que el décimo dominio y el décimo primer dominio no se asocian juntos para formar el sitio de unión de epítopo (3) o el sitio de unión de epítopo (4) ;-477- IMPI INSTÍTUT» mBicani Pt la moheda Γ íNousn» । * i VTAfTy' en donde el séptimo dominio y el décimo primer dominio se asocian juntos para formar un sitio de unión (VL3) (VH3) que unen al epítopo (3) ;en donde el octavo dominio y el décimo dominio se asocian juntos para formar el sitio de unión (VL4)(VH4) que unen al epítopo (4).
  6. 6
    La molécula de diacuerpo de conformidad con la reivindicación 5, caracterizada porque la cuarta cadena de polipéptidos comprende adicionalmente:(iii) un dominio de polipéptidos cargados negativa o positivamente que de manera espontánea adquiere la conformación helicoidal unida al décimo primer dominio, en donde la tercera y cuarta cadenas de polipéptidos contienen el dominio de polipéptido cargado positivamente que de manera espontánea adquiere una conformación helicoidal y la otra de la tercera y cuarta cadenas de polipéptidos contienen el dominio de polipéptidos cargado negativamente que de manera espontánea adquiere una conformación helicoidal.
  7. 7
    La molécula de diacuerpo de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, caracterizada porque el dominio de polipéptido cargado negativamente que de manera espontánea adquiere una conformación helicoidal es una E. coli (SEQ ID NO:299).
  8. 8
    La molécula de diacuerpo de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7, caracterizada - 478 - IHJTHUTU MBtICAM nSlAMOHtOAi INDURTRIAt porque el dominio de polipéptido cargado positivamente que de manera espontánea adquiere una conformación helicoidal es una K. COli (SEQ ID N0:300).
  9. 9
    La molécula de diacuerpo de conformidad con la reivindicación 1 ó 2, caracterizada porque la primer cadena de polipéptido comprende adicionalmente :(iv) una porción de polipéptido de una proteína que se une a una proteína sérica, la porción de polipéptido es capaz de unirse a la proteína sérica.
  10. 10
    La molécula de diacuerpo de conformidad con la reivindicación 9, caracterizada porque la segunda cadena de polipéptido comprende adicionalmente:(iv) una porción de polipéptido de una proteína que se une a una proteína sérica, la porción de polipéptido es capaz de unirse a la proteína sérica.
  11. 11
    La molécula de diacuerpo de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 9 a 10, caracterizada porque la proteína que se une a una proteína sérica es una proteína que se une a albúmina.
  12. 12
    La molécula de diacuerpo de conformidad con la reivindicación 11, caracterizada porque la proteína que une albúmina es proteína G estreptocócica y la porción de polipéptido es un dominio que une albúmina (ABD) de la proteína G estreptocócica.
  13. 13
    La molécula de diacuerpo de conformidad con la --- IMPI iwrrmrro mexjcan ni la mwhbdai INDI '«T»IAI reivindicación 12, caracterizada porque ρΙ.,Ηητηΐηίη q»» np.e· albúmina (ABD) de la proteína G estreptocíca es el dominio 3 de unión a albúmina (ABD3) de la proteína G de Sreptococcus, cepa G148.
  14. 14
    La molécula de diacuerpo de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 8 a 13, caracterizada porque la molécula de diacuerpo presenta una semivida sérica in vivo mayor de 2 horas.
  15. 15
    La molécula de diacuerpo de conformidad con la reivindicación 14, caracterizada porque la molécula de diacuerpo presenta una semivida sérica in vivo mayor de 10 horas.
  16. 16
    La molécula de diacuerpo de conformidad con la reivindicación 15, caracterizada porque la molécula de diacuerpo presenta una semivida sérica in vivo mayor de 20 horas.
  17. 17
    La molécula de diacuerpo de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 16, caracterizada porque tiene un dominio que se une a un epítopo de CD32B y un dominio que se une a un epítopo de CD16.
  18. 18
    La molécula de diacuerpo de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 16, caracterizada porque tiene un dominio que es un ligando de unión para el receptor de grupo 2D citolítico natural (NKG2D).
  19. 19
    La molécula de diacuerpo de conformidad con 480 IMJTWUTO M«ICAN D£ LA HtOPflDAI INDUSTRIA* cualquiera de las reivindicaciones 1 a ία na-raoj-Ari zada porque tiene un dominio que es un ligando de unión para el dominio de unión a receptor de linfocitos T (TCR).
  20. 20
    La molécula de diacuerpo de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 19, caracterizada porque la molécula se une a un antígeno asociado a tumor.
  21. 21
    La molécula de diacuerpo de conformidad con la reivindicación 20, caracterizada porque el antígeno asociado a tumor es un antígeno de cáncer de mama, un antígeno de cáncer de ovario, un antígeno de cáncer de próstata, un antígeno de cáncer cervical, un antígeno de carcinoma pancreático, un antígeno de cáncer de pulmón, un antígeno de cáncer de vejiga, un antígeno de cáncer de colon, un antígeno de cáncer testicular, un antígeno de cáncer de glioblastoma, un antígeno asociado con cáncer maligno de linfocitos B, un antígeno asociado con mieloma múltiple, un antígeno asociado con 1inforna no Hodgkiniano o un antígeno asociado con leucemia linfocítica crónica.
  22. 22
    La molécula de diacuerpo de conformidad con la reivindicación 20, caracterizada porque el antígeno asociado a tumor es A33;ADAM-9;ALCAM;BI;BAGE;beta-catenina;CA125;carboxipeptidasa M;CD5;CD19;CD20;CD22;CD23;CD25;CD27;CD28;CD32B;CD36;CD40;CD45;CD46;CD56;CD79a;CD79b;CD103;CD154;CDK4;CEA;CTLA4;citoqueratina 8;EGFR;un receptor de efrina;ErbBl;ErbB3;ErbB4;GAGE-1, GAGE- 2;GD2;GD3;GM2;gplOO;HER-2/neu;papilomavirus E6 humano;papilomavirus-E7 humano;integrina alfa-V-beta-6;JAM-3;KID3;KID31;KSA (17-1A);LUCA-2;IMAGE-1;MAGE-3;MART;ΜΠΟΙ;MUM-1;N-acetilglucosaminiltransferasa;oncostatina M 5 (receptor beta de oncostatina);pl5;PIPA;PSA;PSMA;RAAG10;ROR1;SART;sTn;TES7;el receptor TNF-α, el receptor TNF-β, el receptor TNF-γ, el receptor de transferrina o el receptor de VEGF.
  23. 23
    La molécula de diacuerpo de conformidad con la 10 reivindicación 22, caracterizada porque el antígeno asociado a tumor es HER-2/neu. - 482 - Dt LA PROI’IaLaD INuliSTRlAL inmunoglobulina (VH1) específica para el epítopo (1); (iii) un dominio (F) que comprende un dominio de una región 1 constante de cadena pesada (CH1) o una porción del mismo, y (iv) una región de bisagra y una región 2 constante de cadena pesada (CH2) y una región 3 constante de cadena pesada (CH3); en donde:los dominios (A) y (B) no se asocian entre si para formar un sitio de unión a epítopo;los dominios (D) y (E) no se asocian entre si para formar un sitio de unión a epítopo;los dominios (A) y (E) se asocian para formar un sitio de unión que se une al epítopo (1);los dominios (B) y (D) se asocian para formar un sitio de unión que se une al epítopo (2);los dominios (C) y (F) se asocian juntos por medio de un enlace disulfuro para formar un dominio CH1 o una porción del mismo;y en donde el dominio que promueve el heterodimero une: (1) los dominios (B) y (C) ;o (2) los dominios (E) y (F);y se seleccionan del grupo que consiste de las SEC ID NOS: 278, 280, 281, 283, 284, 286, 287, 288, 289, 290, - 483 - 291, 293, 295 y 297. 10. La molécula de diacuerpo de conformidad con la reivindicación 9, caracterizada porque la molécula comprende adicionalmente una tercera cadena de polipéptido y una cuarta cadena de polipéptido, en donde: (A) la tercera cadena de polipéptido comprende: (i) un dominio (G) que comprende una región de unión de un dominio variable de cadena ligera de una primera inmunoglobulina (VL1) específica para un epítopo (3);(ii) un dominio (H) que comprende una región de unión de un dominio variable de cadena pesada de una segunda inmunoglobulina (VH2) específica para un epítopo (4);y (iii) un dominio (I) que comprende un dominio de región constante de cadena ligera (CL) o una porción del mismo;(B) la cuarta cadena de polipéptido comprende: (i) un dominio (J) que comprende una región de unión de un dominio variable de cadena ligera de la segunda inmunoglobulina (VL2) especifica para el epítopo (4);(ii) un dominio (K) que comprende una región de unión de un dominio variable de cadena pesada de la primera inmunoglobulina (VH1) específica para el epítopo (3);(iii) un dominio (L) que comprende un dominio de una región 1 constante de cadena pesada (CH1) o una porción del mismo;484 * o । .,„¿ ,, ! en donde: '¡ i ' :I los dominios (G) y (H) no se asocian entre si para formar un sitio de unión a epítopo;1 i los dominios (J) y (K) no se asocian entre sí paira formar un sitio de unión a epítopo;los dominios (G) y (K) se asocian para formar un sitio de unión que se une al epítopo (3);los dominios (H)¡y ' '' i (J) se asocian para formar un sitio de unión que une al ' t epítopo (4);H los dominios (I) y (L) se asocian juntos por medio I de un enlace disulfuro para formar un dominio CH1 o una i porción del mismo;y la cadena pesada (CH3) de la asocian para formar una región Fe;y· ! en donde el dominio que promueve el heterodimé'ro une:' ' región de bisagra, la región 2 constante de '' ! (CH2) y la región 3 constante de cadena pesada segunda y cuarta cadenas de polipéptido se (I) los dominios (B) y (C);o · ' (2) los dominios (E) y (F) ;t , · 1 1 (3) los dominios (H) e 1 (i);o , „ , (4) los dominios [K) y ( L);y se seleccionan del grupo que consiste de las ‘.SEC ID NOS: 278, 280, 281, 283, 284, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 293, 295 y 297.Ϊ i • I - 485 IMPIOS ΙΗ.Τπτντο MOICa.s.j V - i emwifia»·» Vy .λ-j'i / INDUSTUiaL 11. El diacuerpo de conformidad con la reivindicación 1, 2, 3, 4, 5, 6 ó 7, caracterizado porque por lo menos una de la primera o la segunda cadenas de polipéptidos del diacuerpo comprenden adicionalmente un separador helicoidal E o helicoidal K. 12. El diacuerpo de conformidad con la reivindicación 11, caracterizado porque ambas, la primera y segunda cadenas de polipéptidos del diacuerpo comprenden un separador helicoidal E o helicoidal K. 13. El diacuerpo de conformidad con la reivindicación 11, caracterizado porque el separador helicoidal E o helicoidal K está unido a un fragmento Fe. . 14. El diacuerpo de conformidad con la reivindicación 12, caracterizado porque el separador helicoidal E o helicoidal K está unido a un fragmento Fe. 15. El diacuerpo de conformidad con 'la reivindicación 11, caracterizado porque el separador helicoidal E o helicoidal K está unido a una porción de polipéptido de una proteina que une suero, la porción de polipéptido es capaz de unirse a la proteína que une suero. 16. El diacuerpo de conformidad con la reivindicación 15, caracterizado porque la proteína que une suero es una proteína que une albúmina. 17. El diacuerpo de conformidad con la reivindicación 16, caracterizado porque la proteina que une 486 ® τπτνη’ müica-·, « LA MOHUJ albúmina es proteina G estreptococica y la porción de polipéptido es un dominio que une albúmina (ABD) de la proteina G estreptococica. 18. El diacuerpo de conformidad con la 5 reivindicación 17, caracterizado porque el dominio que une albúmina (ABD) de la proteína estreptococica G es el dominio 3 que une albúmina (ABD3) de la proteína G de Streptocodcus cepa G148. 19. El diacuerpo de conformidad con la 10 reivindicación 1, 2, 3, 4, 5, 6 ó 7, caracterizado porque presenta una vida media sérica in vivo mayor de 2 horas. 20. El diacuerpo de conformidad con la reivindicación 19, caracterizado porque el diacuerpo presenta una vida media sérica in vivo mayor de 10 horas. 15 21. El diacuerpo de conformidad con la reivindicación 19, caracterizado porque el diacuerpo presenta una vida media sérica in vivo mayor de 20 horas. 22. La molécula de diacuerpo de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7 o 10 a 22, 20 caracterizada porque tiene un dominio que es un ligando de unión para el receptor del grupo 2D citolítico natural (NKG2D). 23. La molécula de diacuerpo de conformidad con la reivindicación 22, caracterizada porque la molécula 25 adicionalmente se une a un antígeno asociado a tumor. 487
  24. 24
    La molécula de diacuerpo de conformidad con la reivindicación 23, caracterizada porque el antigeno asociado a tumor es un antígeno de cáncer de mama, un antígeno de cáncer de ovario, un antígeno de cáncer de próstata, un antigeno de cáncer cervical, un antígeno de carcinoma pancreático, un antigeno de cáncer pulmonar, un antígeno de cáncer de vejiga, un antígeno de cáncer de colon, un antígeno de cáncer testicular, un antígeno de cáncer de glioblastoma, un antigeno asociado con un cáncer maligno de linfocitos B, un antígeno asociado con mieloma múltiple, un antigeno asociado con linfoma no Hodgkiniano o un antígeno asociado con leucemia linfocítica crónica.
  25. 25
    La molécula de diacuerpo de conformidad con la reivindicación 23, caracterizada porque el antigeno asociado a tumor es A33;ADAM-9;ALCAM;Bl;BAGE;beta-catenina;CA125;carboxipeptidasa M;CD5;CD19;CD20;CD22;CD23;CD25;CD27;CD28;CD32B;CD36;CD40;CD45;CD46;CD56;CD79a;CD79b;CD103;CD154;CDK4;CEA;CTLA4;citoqueratina 8;EGFR;un receptor de efrina;ErbBl;ErbB3;ErbB4;GAGE-1;GAGE2;GD2;GD3;GM2;gplOO;HER-2/neu;papiloma virus humano-E6;papiloma virus humano-E7;integrina alfa-V-beta-6;JAM-3;KID3;KID31;KSA;LUCA-2;MAGE-1;MAGE-3;MART;MUC-1;MÜM-1;N-acetilglucosaminiltransferasa;oncostatina M;pl5;PIPA;PSA;PSMA;RAAG10;ROR1;SART;sTn;TES7;el receptor TNF-a;el receptor TNF-β;el receptor ΤΝΕ-γ;el receptor de - 488 IMPI iNsrmnc mexicana DI La ILeriSDAD ¡NUUJTkIAL transferrina o el receptor VEGF.
  26. 26
    La molécula de diacuerpo de conformidad con la reivindicación 25, caracterizada porque el antígeno asociado a tumor es HER-2/neu.
  27. 27
    La molécula de diacuerpo de conformidad con la reivindicación 1, 2, 3, 4, 5, 6, ó 7, caracterizada porque comprende un dominio de unión a receptor de linfocitos T (TCR).
  28. 28
    La molécula de diacuerpo de conformidad con la reivindicación 27, caracterizada porque la molécula adicionalmente se une a un antígeno asociado a tumor.
  29. 29
    La molécula de diacuerpo de conformidad con la reivindicación 28, caracterizada porque el antígeno asociado a tumor es un antígeno de cáncer de mama, un antígeno de cáncer de ovario, un antígeno de cáncer de próstata, un antígeno de cáncer cervical, un antígeno de carcinoma pancreático, un antígeno de cáncer pulmonar, un antígeno de cáncer de vejiga, un antigeno de cáncer de colon, un antígeno de cáncer testicular, un antígeno de cáncer de glioblastoma, un antígeno asociado con un cáncer maligno de linfocitos B, un antígeno asociado con mieloma múltiple, un antígeno asociado con linfoma no Hodgkiniano o un antígeno asociado con leucemia linfocítica crónica.
  30. 30
    La molécula de diacuerpo de conformidad con la reivindicación 28, caracterizada porque el antígeno asociado IMPI ÍN*T|TUTV v.ixiCamc HELA FEC.P’kr Ab industrial 4 89 — a tumor es A33;ADAM-9;ALCAM;Bl;BAGE;beta-catenina;CA125;carboxipeptidasa M;CD5;CD19;CD20;CD22;CD23;CD25;CD27;CD28;CD32B;CD36;CD40;CD45;CD46;CD56;CD79a;CD79b;CD103;CD154;CDK4;CEA;CTLA4;citoqueratina 8;EGF5 R;un receptor de efrina;ErbBl;ErbB3;ErbB4;GAGE-1;GAGÉ2;GD2;GD3;GM2;gplOO;HER-2/neu;papiloma virus humano-E6;papiloma virus humano-E7;integrina alfa-V-beta-6;JAM-3;KID3;KID31;KSA;LUCA-2;MAGE-1;MAGE-3;MART;MUC-1;MUM-1;N-acetilglucosaminiltransferasa;oncostatina M;pl5;PIPA;10 PSA;PSMA;RAAG10;ROR1;SART;sTn;TES7;el receptor TNF-a;el receptor TNF-β;el receptor TNF-γ;el receptor de transferrina o el receptor VEGF.
  31. 31
    La molécula de diacuerpo de conformidad con la reivindicación 30, caracterizada porque el antigeno asociado 15 a tumor es HER-2/neu.
Independent claims31