CZ2003291A3

Dual specific antibodies, processes of their preparation and use

Abstract

This record has no abstract on file.

CZ2003291A3, drawing sheet 1
Sheet 1 of 10

Term

Term ended

Projected expiry passed 28 June 2021, 5.2 years ago.

  1. Priority
  2. Filed
  3. Published
  4. Projected expiry
  5. Today

1 claim: 1 independent, 0 dependent

  1. 1
    PATENTOVÉ NÁROKY 1. Duálně specifická protilátka nebo její antigen vážící část, která specificky váže ' interleukin-1 a a interleukin-1 β. 2. Duálně specifická protilátka podle nároku 1 nebo její antigen vážící část, která váže interleukin -la s rozpadovou Κ ο η· rychlostní konstantou o hodnotě 0,1 s' 1 nebo menší, stanoveno povrchovou plazmonovou rezonancí, nebo která inhibuje aktivitu interleukinu-ΐα s IC50 o hodnotě 1 χ 10' 5 M nebo menší. 3. Duálně specifická protilátka podle nároku 1 nebo její antigen vážící část, která váže interleukin -1β s rozpadovou Kon rychlostní konstantou o hodnotě 0,1 s' 1 nebo menší, stanoveno povrchovou plazmonovou rezonancí, nebo která inhibuje aktivitu interleukinu-1 β s IC50 o hodnotě 1 x 10‘ 5 M nebo menší. 4. Způsob získání duálně specifické protilátky, která specificky váže interleukin-1 a a interleukin-1β, vyznačující se tím, že se:poskytne antigen, který obsahuje společný strukturní prvek IL-Ια i IL-Ιβ;tomuto antigenu se vystaví soubor protilátek a tento soubor se selektuje na protilátku, která specificky váže IL-1 a a IL-Ιβ, čímž se získá duálně specifická protilátka. 5. Způsob podle nároku 4, vyznačující se tím, že tento antigen se sestrojí na základě styčné topologické oblasti identity mezi IL-1 a a IL-Ιβ. 6. Způsob podle nároku 5, vyznačující se tím, že tento antigen obsahuje aminokyselinovou sekvenci NEAQITDF (SEQ ID NO:1) nebo dNdEdAdQNITDF. 7. Způsob podle nároku 4, vyznačující se tím, že tento antigen se sestrojí na základě strukturního napodobování smyčky nativního stavu IL-1 a a IL-Ιβ. 8. Způsob podle nároku 7, vyznačující se tím, že tímto antigenem je cyklický peptid, obsahující aminokyselinovou sekvenci cyklo-MAFLRANQNNGKISVAL-(PG) (SEQ ID NO:2). 9. Způsob podle nároku 4, vyznačující se tím, že tento antigen se sestrojí na základě vzájemného spojení překrývajících se částí IL-1 a a IL-Ιβ, čímž se vytvoří hybridní molekula. 10. Způsob podle nároku 9, vyznačující se tím, že tento antigen obsahuje aminokyselinovou sekvenci TKGGQDITDFQILENQ (SEQ ID NO:3). • · • 4 44 4 4 4 4 » 4 4 * 4 4 4 4 444 *4 4 4444 4*44 4444 44 44 * 4 ·* 44 44 11. Způsob podle nároku 4, vyznačující se tím, že tento antigen obsahuje aminokyselinovou sekvenci APVRSLNCTLRDSQQKSLVMSGPYELKALHLOGQDMEOOVVFSMGAYKSSKD DAKITVILGLKENLYLSCVLKDDKPTLOLESVDPKNYPKKKMF.KRFVFNKTFI NNKLEFESAQFPNWYISTSQAENMPVFLGGTKGGQDITDFTMQFVSS (SEQ ID NO:4). 12. Způsob podle nároku 4, vyznačující se tím, že soubor protilátek se vystaví antigenu in vivo imunizací živočicha antigenem. 13. Způsob podle nároku 12, vyznačující se tím, že se dále připraví soubor hybridomů z lymfocytů uvedeného živočicha a vybere se hybridom, který vylučuje protilátku, která specificky váže IL-Ία a IL-Ιβ. 14. Způsob podle nároku 12, vyznačující se tím, že uvedený živočich se vybere ze skupiny složené z myší, krys, králíků a koz. 15. Způsob podle nároku 12, vyznačující se tím, že tímto živočichem je knockoutovaná myš, deficientní na IL-la, IL-Ιβ nebo na IL-Ία i IL-Ιβ. 16. Způsob podle nároku 12, vyznačující se tím, že tímto živočichem je myš, která je transgenní vůči lidským imunoglobulinovým genům, takže tato myš po antigenní stimulaci vytváří lidské protilátky. 17. Způsob podle nároku 12, vyznačující se tím, že tímto živočichem je myš s těžkou kombinovanou imunodeficiencí (SCID), která byla rekonstituována s lidskými periferními krevními mononukleámími buňkami nebo lymfatickými buňkami nebo jejich prekurzory. 18. Způsob podle nároku 12, vyznačující se tím, že tímto živočichem je myš, ošetřena letálním ozářením celého těla, následovaným ochranou proti ozáření pomocí buněk kostní dřeně z SCID myši s těžkou kombinovanou imunodeficiencí, následovanou implantací funkčních lidských lymfocytů nebo jejich prekurzorů. 19. Způsob podle nároku 4, vyznačující se tím, že uvedený soubor protilátek se vystaví antigenu in vitro při skríninku knihovny rekombinantních protilátek tímto antigenem. 20. Způsob podle nároku 19, vyznačující se tím, že tato knihovna rekombinantních protilátek je exprimována na povrchu bakteriofága. 21. Způsob podle nároku 19, vyznačující se tím, že tato knihovna rekombinantních protilátek je exprimována na povrchu kvasničných buněk. φφ · · · · · φφφφ φφφφ φφφφ φφ φ · »··»· · · · · * . φ φφφφ φφφφ φφφφ φφ φφ φφφ φφ φφ 22. Způsob podle nároku 19, vyznačující se tím, že tato knihovna rekombinantních protilátek je exprimována na povrchu bakteriálních buněk. 23. Způsob podle nároku 19, vyznačující se tím, že tato knihovna rekombinantních protilátek je exprimována jako fuze RNA-protein. 24. Způsob podle nároku 19, vyznačující se tím, že touto rekombinantní knihovnou je scFv knihovna nebo Fab knihovna. 25. Způsob podle nároku 4, vyznačující se tím, že uvedený soubor protilátek se vystaví antigenů imunizací živočicha antigenem in vivo, následovanou in vitro skríninkem knihovny rekombinantních protilátek, připravené z lymfatických buněk tohoto živočicha s antigenem. 26. Způsob podle nároku 4, vyznačující se tím, že uvedený soubor protilátek se vystaví antigenů imunizací živočicha antigenem in vivo, následovanou afinitním zráním in vitro knihovny rekombinantních protilátek, připravené z lymfatických buněk tohoto živočicha. 27. Způsob podle nároku 4, vyznačující se tím, že uvedený protilátkový soubor se vystaví antigenů imunizací živočicha antigenem in vivo, následovanou výběrem jednotlivých buněk vylučujících protilátky, které váží antigen, a získáním těžkého a lehkého řetězce variabilní oblasti cDNA z jednotlivých buněk. 28. Způsob podle nároku 4, vyznačující se tím, že uvedená duálně specifická protilátka je zcela lidského původu. 29. Způsob podle nároku 4, vyznačující se tím, že uvedenou duálně specifickou protilátkou je chimerní protilátka. 30. Způsob podle nároku 4, vyznačující se tím, že uvedenou duálně specifickou protilátkou je protilátka s implantovanou CDR. 31. Duálně specifická protilátka nebo její antigen vážící fragment, která specificky váže interleukin-ΐα a interleukin-ΐβ, získatelná způsobem podle nároku 4. 32. Způsob získání duálně specifické protilátky, která specificky váže dvě různé, ale strukturálně příbuzné molekuly, vyznačující se tím, že se poskytne antigen, který obsahuje společný strukturní prvek od dvou různých, ale strukturně příbuzných molekul;vystaví se soubor protilátek tomuto antigenů a uvedený soubor protilátek se selektuje na protilátku, která specificky váže tyto dvě různé, ale strukturně příbuzné molekuly, čímž se získá duálně specifická protilátka. ΦΦΦ · φ φ φ φ · φ φ φ φ · φ · · φ · · ···· ·* ·· φφφ φφ φφ 33. Způsob podle nároku 32, vyznačující se tím, že uvedený antigen se sestrojí na základě styčné oblasti identity mezi dvěma různými, ale strukturně příbuznými molekulami. 34. Způsob podle nároku 33, vyznačující se tím, že uvedenými dvěma různými, ale strukturně příbuznými molekulami jsou proteiny a antigen je peptidem, obsahujícím aminokyselinovou sekvenci styčné topologické oblasti identity mezi těmito dvěma proteiny. 35. Způsob podle nároku 32, vyznačující se tím, že uvedený antigen se sestrojí na základě strukturního napodobení smyčky společné nativní struktury dvou různých, ale strukturně příbuzných molekul. 36. Způsob podle nároku 35, vyznačující se tím, že uvedenými dvěma různými, ale strukturně příbuznými molekulami jsou proteiny a antigen je cyklickým peptidem, který strukturně napodobuje smyčku společné nativní struktury těchto dvou proteinů. 37. Způsob podle nároku 32, vyznačující se tím, že antigen se sestrojí na základě spojení překrývajících se částí dvou různých, ale strukturně příbuzných molekul, za vzniku hybridní molekuly. 38. Způsob podle nároku 37, vyznačující se tím, že uvedenýma dvěma různými, ale strukturně příbuznými molekulami jsou proteiny a antigenem je hybridní peptid získaný spojením překrývajících se aminokyselinových sekvencí těchto dvou proteinů. 39. Způsob podle nároku 32, vyznačující se tím, že uvedený antigen je jednou ze dvou různých, ale strukturně příbuzných molekul. 40. Způsob podle nároku 32, vyznačující se tím, že se soubor protilátek vystaví antigenu in vivo imunizací živočicha tímto antigenem. 41. Způsob podle nároku 40, vyznačující se tím, že se navíc připraví panel hybridomů z lymfocytů živočicha a selektuje se hybridom, který vylučuje protilátku, která se specificky váže ke dvěma různým, ale strukturně příbuzným molekulám. 42. Způsob podle nároku 40, vyznačující se tím, že uvedený živočich se vybere ze skupiny, skládající se z myší, krys, králíků a koz. 43. Způsob podle nároku 40, vyznačující se tím, že uvedeným živočichem je knockoutovaná myš, deficientní na endogenní verzi uvedeného antigenu. 44. Způsob podle nároku 40, vyznačující se tím, že tímto živočichem je myš, která je transgenní na lidské imunoglobulinové geny, takže tato myš po stimulaci antigenem vytváří lidské protilátky. 4 45. Způsob podle nároku 40, vyznačující se tím, že uvedeným živočichem je myš s těžkou kombinovanou imunodeficiencí, SCID, která byla obnovena lidskými periferními mononukleárními buňkami nebo lymfatickými buňkami nebo jejich prekurzory. 46. Způsob podle nároku 40, vyznačující se tím, že že uvedeným živočichem je myš, která byla ošetřena letálním ozářením celého těla, následovaným ochranou proti ozáření ve formě buněk kostní dřeně z myši s těžkou kombinovanou imunodeficiencí, SCID, následovanou implantací funkčních lidských lymfocytů. 47. Způsob podle nároku 32, vyznačující se tím, že uvedený soubor protilátek se vystaví antigenů in vitro skríninkem knihovny rekombinantních protilátek uvedeným antigenem. 48. Způsob podle nároku 47, vyznačující se tím, že uvedená knihovna rekombinantních protilátek je exprimována na povrchu bakteriofágu. 49. Způsob podle nároku 47, vyznačující se tím, že uvedená knihovna rekombinantních protilátek je exprimována na povrchu kvasničných buněk. 50. Způsob podle nároku 47, vyznačující se tím, že uvedená knihovna rekombinantních protilátek je exprimována na povrchu bakteriálních buněk. 51. Způsob podle nároku 47, vyznačující se tím, že uvedená knihovna rekombinantních protilátek je exprimována ve formě fúzí RNA-protein. 52. Způsob podle nároku 47, vyznačující se tím, že uvedenou knihovnou rekombinantních protilátek je scFv knihovna nebo Fab knihovna. 53. Způsob podle nároku 32, vyznačující se tím, že se uvedený soubor protilátek vystaví antigenů imunizací živočicha antigenem in vivo, následovanou in vitro skríninkem knihovny rekombinantních protilátek připravené z lymfatických buněk živočicha, pomocí antigenů. 54. Způsob podle nároku 32, vyznačující se tím, že se uvedený soubor protilátek vystaví antigenů in vivo imunizací živočicha tímto antigenem, následovanou in vitro afinitním zráním knihovny rekombinantních protilátek, připravené z lymfatických buněk tohoto živočicha. 55. Způsob podle nároku 32, vyznačující se tím, že se uvedený soubor protilátek vystaví antigenů imunizací živočicha antigenem in vivo, následovanou selekcí jednotlivých buněk, vylučujících protilátky, které váží antigen a získáním těžkých a lehkých řetězců variabilní oblasti cDNA z jednotlivých buněk. titi titi ♦ · · · ti · ti • * • titi ti titi 56. Způsob podle nároku 32, vyznačující se tím, že uvedenou duálně specifickou protilátkou je zcela lidská protilátka. 57. Způsob podle nároku 32, vyznačující se tím, že uvedenou duálně specifickou protilátkou je chimérická protilátka. 58. Způsob podle nároku 32, vyznačující se tím, že uvedenou duálně specifickou protilátkou je protilátka s implantovanou CDR. 59. Duálně specifická protilátka nebo její antigen vážící část, získatelná způsobem podle nároku 32. 60. Způsob detekce IL-la nebo IL-Ιβ v biologickém vzorku nebo v tkáni, vyznačující se tím, že se biologický vzorek nebo tkáň, s předpokládaným obsahem IL-la nebo IL-Ιβ, uvede do kontaktu s duálně specifickou protilátkou nebo s její antigen vážící částí podle nároku 1 a v biologickém vzorku nebo v tkáni se detekuje IL-la nebo IL-Ιβ. 61. Způsob podle nároku 60, vyznačující se tím, že se IL-la nebo IL-Ιβ detekuje pro diagnostické účely. 62. Způsob podle nároku 60, vyznačující se tím, že uvedeným biologickým vzorkem je in vitro vzorek. 63. Způsob podle nároku 60, vyznačující se tím, že uvedená tkáň je lokalizována in vivo v subjektu a uvedený způsob zahrnuje in vivo zobrazení této tkáně. 64. Způsob inhibice aktivity IL-la nebo IL-Ιβ ,vyznačující se tím, že se IL-la nebo IL-Ιβ uvedou do kontaktu s duálně specifickou protilátkou nebo její antigen vážící částí podle nároku 1, takže se aktivita IL-la nebo IL-Ιβ inhibuje. 65. Způsob podle nároku 64, vyznačující se tím, že se aktivita IL-la nebo IIL1β inhibuje in vitro. 66. Způsob léčby choroby, která je spojená s interleukinem-1, vyznačující se tím, že se subjektu, trpícímu chorobou, která je spojená s interleukinem-1, podává duálně specifická protilátka nebo její antigen vážící část podle nároku 1, takže se tento subjekt léčí na chorobu spojenou s interleukinem-1. 67. Způsob podle nároku 66, vyznačující se tím, že touto chorobou, která je spojena s interleukinem-1, je zánětlivá choroba. 68. Způsob podle nároku 66, vyznačující se tím, že touto chorobou, která je spojena s interleukinem-1, je autoimunitní choroba. ·'· • »♦· 9 9 9 99· 9 9 69. Způsob podle nároku 66, vyznačující se tím, že choroba, která je spojena s interleukinem-1, se vybere ze skupiny, která se skládá z reumatoidní artritidy, Crohnovy choroby, mnohočetné sklerosy, na inzulínu závislého diabetů a psoriázy. 70. Způsob přípravy knihovny protilátky nebo její antigen vážící části, vyznačující se tím, že zahrnuje kroky: a) získání knihovny A rekombinantního těžkého řetězce nebo jeho antigen vážící části ze souboru protilátek, které vznikly po expozici prvnímu antigenů;b) získání knihovny B rekombinantního lehkého řetězce nebo jeho antigen vážící části ze souboru protilátek, které vznikly po expozici prvnímu antigenů;c) získání knihovny C rekombinantního těžkého řetězce nebo jeho antigen vážící části ze souboru protilátek, které vznikly po expozici druhému antigenů;d) získání knihovny D rekombinantního lehkého řetězce nebo jeho antigen vážící části ze souboru protilátek, které vznikly po expozici druhému antigenů;e) kombinování knihovny A rekombinantního těžkého řetězce nebo jeho antigen vážící části s knihovnou D rekombinantního lehkého řetězce nebo jeho antigen vážící části, aby se získala knihovna X protilátky nebo její antigen vážící části a/nebo kombinování knihovny C rekombinantního těžkého řetězce nebo jeho antigen vážící části s knihovnou B rekombinantního lehkého řetězce nebo jeho antigen vážící části, aby se zsíkala knihovna Y protilátky nebo její antigen vážící části. 71. Způsob přípravy knihovny protilátky nebo její antigen vážící části podle nároku 70, vyznačující se tím, že dále zahrnuje kroky kombinování knihovny X protilátky nebo její antigen vážící části s knihovnou Y protilátky nebo její antigen vážící části, aby se získala knihovna Z protilátky nebo její antigen vážící části. 72. Knihovna X protilátky nebo její antigen vážící části, získaná způsobem podle nároku 70. 73. Knihovna Y protilátky nebo její antigen vážící části, získaná způsobem podle nároku 70. 74. Knihovna Z protilátky nebo její antigen vážící části, získaná způsobem podle nároku 71. 75. Způsob výroby duálně specifické protilátky nebo její antigen vážící části, vyznačující se tím, že zahrnuje kroky: a) získání knihovny A rekombinantního těžkého řetězce nebo jeho antigen vážící části ze souboru protilátek, vzniklých expozicí prvnímu antigenů;b) získání knihovny B rekombinantního lehkého řetězce nebo jeho antigen vážící části ze souboru protilátek vzniklých expozicí prvnímu antigenů;• 9 c) získání knihovny C rekombinantního těžkého řetězce nebo jeho antigen vážící části ze souboru protilátek vzniklých expozicí druhému antigenů;d) získání knihovny D rekombinantního lehkého řetězce nebo jeho antigen vážící části ze souboru protilátek vzniklých expozicí druhému antigenů;e) kombinování knihovny A rekombinantního těžkého řetězce nebo jeho antigen vážící části s knihovnou D rekombinantního lehkého řetězce nebo jeho antigen vážící části, aby se získala knihovna X protilátky nebo její antigen vážící části a/nebo kombinování knihovny C rekombinantního těžkého řetězce nebo jeho antigen vážící části s knihovnou B rekombinantního lehkého řetězce nebo jeho antigen vážící části, aby se získala knihovna Y protilátky nebo její antigen vážící části a f) selektování knihovny X protilátky nebo její antigen vážící části a/nebo knihovny Y protilátky nebo její antigen vážící části na protilátku nebo její antigen vážící část, která váže jak první, tak i druhý antigen. 76. Duálně specifická protilátka, získaná způsobem podle nároku 75. 77. Způsob výroby duálně specifické protilátky nebo její antigen vážící části, vyznačující se tím, že zahrnuje kroky: a) získání knihovny A rekombinantního těžkého řetězce nebo jeho antigen vážící části ze souboru protilátek, vzniklých expozicí prvnímu antigenů;b) získání knihovny B rekombinantního lehkého řetězce nebo jeho antigen vážící části ze souboru protilátek vzniklých expozicí prvnímu antigenů;c) získání knihovny C rekombinantního těžkého řetězce nebo jeho antigen vážící části ze souboru protilátek vzniklých expozicí druhému antigenů;d) získání knihovny D rekombinantního lehkého řetězce nebo jeho antigen vážící části ze souboru protilátek vzniklých expozicí druhému antigenů;e) kombinování knihovny A rekombinantního těžkého řetězce nebo jeho antigen vážící části s knihovnou D rekombinantního lehkého řetězce nebo její antigen vážící části, aby se získala knihovna X protilátky nebo její antigen vážící části a/nebo kombinování knihovny C rekombinantního těžkého řetězce nebo jeho antigen vážící části s knihovnou B rekombinantního lehkého řetězce nebo jeho antigen vážící části, aby se získala knihovna Y protilátky nebo její antigen vážící části a ·· ·· ·♦ ·* · ···· · · · · ·· · • ··· · · · · · · · • ·«·« · · · · ............... f) kombinování knihovny X protilátky nebo její antigen vážící části s knihovnou Y protilátky nebo její antigen vážící části, aby se získala knihovna Z protilátky nebo její antigen vážící části a g) selektování knihovny Z protilátky nebo její antigen vážící části na protilátku nebo její antigen vážící část, která váže jak první, tak i druhý antigen. 78. Duálně specifická protilátka nebo její antigen vážící část, získaná způsobem podle nároku ΊΊ. 19. Způsob podle kteréhokoliv z nároků 70, 75 a 77, vyznačující se tím, že se uvedený první a druhý antigen nezávisle vybere ze skupiny, která se skládá z proteinů, polypeptidů a peptidů, za předpokladu, že tento první a druhý antigen nejsou stejné. 80. Způsob podle nároku 79, vyznačující se tím, že uvedenými proteiny, polypeptidy a peptidy jsou vylučované proteiny nebo povrchové receptory. 81. Způsob podle nároku 80, vyznačující se tím, že se vylučovaný protein vybere ze skupiny, která se skládá z EFN, TNF, interleukinu, IL-10, PF4, GRO, 9E3, EMAP-II, CSF, FGF a PDGF. 82. Způsob podle nároku 81, vyznačující se tím, že uvedeným prvním antigenem je IL-Ια a druhým antigenem je IL-Γβ. 83. Nukleotidová sekvence, kódující každý člen knihovny nebo knihoven protilátky nebo její antigen vážící části podle kteréhokoliv z nároků 72, 73 nebo 74. 84. Nukleotidová sekvence kódující duálně specifickou protilátku nebo její antigen vážící část podle kteréhokoliv z nároků 76 nebo 78. 85. Vektor, zahrnující nukleotidovou sekvenci, kódující člen knihovny nebo knihoven protilátky nebo její antigen vážící části podle kteréhokoliv z nároků 72, 73 nebo 74. 86. Vektor, zahrnující nukleotidovou sekvenci kódující duálně specifickou protilátku nebo její antigen vážící část podle kteréhokoliv z nároků 76 nebo 78. 87. Hostitelská buňka, transfektovaná vektorem podle nároku 85. 88. Hostitelská buňka, transfektovaná vektorem podle nároku 86. Seznam sekvencí NEAQNITDF (SEQ ID NO: 1) Cyklo-MAFLRANQNNGKISVAL(PG) (SEQ ID NO:2) TKGGQDITDFQILENQ (SEQ ID NO:3) AP VRSLNCTLRD S QQKSL VMMSGP YELKALHLQGQDMEQQ VVFSMGAYKS SKD DAKITVILGLKEKNLYLSCVLKDDKPTLQLESVDPKNYPKKKMEKRFVFNKIEIN NKLEFESAQFPNWYISTSQAENMPVFLGGTKGGQDITDFTMQFVSS (SEQ ID NO:4)