Nova Patents
PL211164B1

Modified peptides as therapeutic agents

Abstract

The present invention concerns fusion of Fc domains with biologically active peptides and a process for preparing pharmaceutical agents using biologically active peptides. In this invention, pharmacologically active compounds are prepared by a process comprising: a) selecting at least one peptide that modulates the activity of a protein of interest; and b) preparing a pharmacologic agent comprising an Fc domain covalently linked to at least one amino acid of the selected peptide. Linkage to the vehicle increases the half-life of the peptide, which otherwise would be quickly degraded in vivo. The preferred vehicle is an Fc domain. The peptide is preferably selected by phage display, E. coli display, ribosome display, RNA-peptide screening, or chemical-peptide screening.

PL211164B1, drawing sheet 1
Sheet 1 of 60

Term

Term ended

Expired 25 October 2019, 6.9 years ago.

  1. Priority
  2. Filed
  3. Granted
  4. Expired
  5. Today

40 claims: 16 independent, 24 dependent

  1. 1
    The compound of formula (X1) aF1- (X2) b and its multimers, where:1. Zwią zek o wzorze (X1)a-F1-(X2)b oraz jego multimery, gdzie: F.1 is an Fc domain;F1 jest domeną Fc;X1 and X2, each, is independently selected from - (L.1) cP1, - (L.1) cP1- (L.2) d -P2, - (L.1) cP1- (L.2)dP.2- (L.3) eP3, and - (L.1) cP1- (L.2) dP2- (L.3) e -P3- (L.4) fP4 X1 oraz X2, każdy, jest niezależnie wybrany spośród -(L1)c-P1, -(L1)c-P1-(L2)d -P2, -(L1)c-P1-(L2)dP2-(L3)e-P3, oraz -(L1)c-P1-(L2)d-P2-(L3)e -P3-(L4)f-P4 P.1, P2, P3 and P4each independently represent randomized sequences of pharmacologically active peptides;P1, P2, P3 oraz P4, każdy niezależnie, oznaczają randomizowane sekwencje farmakologicznie aktywnych peptydów;L.1, L.2, L.3 and L.4each independently represent a linker;aa, b, c, d, e and f are each independently 0 or 1, with the proviso that at least one of a and b is 1 and "peptide" denotes molecules of 2 to 40 amino acids, and neither X1nor X2 it is not a naturally occurring protein. L1, L2, L3 oraz L4, każdy niezależnie, oznaczają linker;a a, b, c, d, e oraz f, każdy niezależnie, oznaczają 0 lub 1, z tym zastrzeżeniem, że co najmniej jeden z symboli a oraz b jest 1, zaś określenie „peptyd” oznacza cząsteczki o 2 do 40 aminokwasach i ani X1, ani X2 nie oznacza proteiny występującej w przyrodzie.
  2. 9
    A compound according to claim Wherein the IL-1 antagonist peptide sequence is selected from the group consisting of SEQ ID NOS:212, 907, 908, 909, 910, 917 and 979. 9. Związek według zastrz. 8, gdzie sekwencja peptydu antagonisty IL-1 jest wybrana z grupy obejmującej sekwencje SEQ ID NOS: 212, 907, 908, 909, 910, 917 i 979.
  3. 21
    DNA encoding a compound as defined in claim 1 1. 21. DNA kodujący związek zdefiniowany w zastrz. 1.
  4. 22
    An expression vector comprising DNA as defined in claim 1 21. 22. Wektor ekspresji zawierający DNA zdefiniowany w zastrz. 21.
  5. 23
    A host cell comprising an expression vector as defined in claim 1 22. 23. Komórka gospodarza zawierająca wektor ekspresji zdefiniowany w zastrz. 22.
  6. 26
    The use of a compound as defined in claim 1 1 as a therapeutic or prophylactic agent. 26. Zastosowanie związku określonego w zastrz. 1 jako środka terapeutycznego lub profilaktycznego.
  7. 29
    The method according to p. 27 or 28, characterized in that the randomized EPO-mimetic peptide is used as the peptide. 29. Sposób według zastrz. 27 albo 28, znamienny tym, że jako peptyd stosuje się randomizowany peptyd EPO-mimetyczny.
  8. 30
    Sposób według zastrz. 27 albo 28, znamienny tym, że jako peptyd stosuje się randomizowany peptyd TPO-mimetyczny. thirty. The method according to p. 27 or 28, characterized in that the randomized TPO-mimetic peptide is used as the peptide.
  9. 31
    The method according to p. 27 or 28, wherein the peptide is a randomized IL-1 antagonist peptide. 31. Sposób według zastrz. 27 albo 28, znamienny tym, że jako peptyd stosuje się randomizowany peptyd antagonistę IL-1.
  10. 32
    The method according to p. 27 or 28, characterized in that a randomized GCSF-mimetic peptide is used as the peptide. 32. Sposób według zastrz. 27 albo 28, znamienny tym, że jako peptyd stosuje się randomizowany peptyd GCSF-mimetyczny.
  11. 33
    The method according to p. 27 or 28, characterized in that a TNF antagonist randomized peptide is used as the peptide. 33. Sposób według zastrz. 27 albo 28, znamienny tym, że jako peptyd stosuje się randomizowany peptyd antagonistę TNF.
  12. 34
    The method according to p. 27 or 28, characterized in that the peptide is selected from Tables 4 to 20. 34. Sposób według zastrz. 27 albo 28, znamienny tym, że jako peptyd stosuje się peptyd wybrany z Tablic 4 do 20.
  13. 35
    The method according to p. 27, characterized in that a compound having the structure defined by formula (X1) aF1- (X2) b or its multimer, where:35. Sposób według zastrz. 27, znamienny tym, że wytwarza się związek mający budowę określoną wzorem (X1)a-F1-(X2)b lub jego multimer, gdzie: F.1 is an Fc domain;F1 jest domeną Fc;X1 and X2each, independently, is selected from - (L.1) cP1, - (L.1) cP1- (L.2) d -P2, - (L.1) cP1- (L.2)dP.2- (L.3) eP3 and - (L.1) cP1- (L.2) dP2- (L.3) e -P3- (L.4) fP4 X1 oraz X2, każdy niezależnie, jest wybrany spośród -(L1)c-P1, -(L1)c-P1-(L2)d -P2, -(L1)c-P1-(L2)dP2-(L3)e-P3 oraz -(L1)c-P1-(L2)d-P2-(L3)e -P3-(L4)f-P4 PL 211 164 B1 PL 211 164 B1 413 413 P.1, P2, P3 and P4each independently represent randomized sequences of pharmacologically active peptides;P1, P2, P3 oraz P4, każdy niezależnie, oznaczają randomizowane sekwencje farmakologicznie aktywnych peptydów;L.1, L.2, L.3 and L.4each independently is a linker;aa, b, c, d, e and f each independently represent "0" or "1" with the proviso that at least one of "a" and "b" represents "1" and neither X1nor X2 it is not a naturally occurring protein. L1, L2, L3 oraz L4, każdy niezależnie, jest linkerem;a a, b, c, d, e oraz f, każdy niezależnie, oznacza „0” lub „1”, z tym zastrzeżeniem, że co najmniej jeden z symboli „a” i „b” oznacza „1” i ani X1, ani X2 nie oznacza proteiny występującej w przyrodzie.
  14. 38
    The method according to p. 27, 28, or 35, or 36, or 37, characterized in that the Fc domain, also referred to as F1 the Fc domain of IgG is used. 38. Sposób według zastrz. 27 albo 28, albo 35, albo 36, albo 37, znamienny tym, że jako domenę Fc, określoną także symbolem F1 stosuje się domenę Fc IgG.
  15. 39
    The method according to p. 27, 28, or 35, or 36, or 37, characterized in that the Fc domain, also referred to as F1 the Fc domain of IgG1 is used. 39. Sposób według zastrz. 27 albo 28, albo 35, albo 36, albo 37, znamienny tym, że jako domenę Fc, określoną także symbolem F1 stosuje się domenę Fc IgG1.
  16. 40
    The method according to p. 27, 28, or 35, or 36, or 37, characterized in that the Fc domain, also referred to as F1 an Fc domain comprising the sequence of SEQ ID NO:2 is used. 40. Sposób według zastrz. 27 albo 28, albo 35, albo 36, albo 37, znamienny tym, że jako domenę Fc, określoną także symbolem F1 stosuje się domenę Fc obejmującą sekwencję SEQ ID NO: 2. 414 414 PL 211 164 B1 PL 211 164 B1 Drawings Rysunki FIG. 1 FIG. 1 Peptide selection Wybór peptydu AND I Optymalizacja peptydu Peptide optimization AND I Generation of an Fc-peptide DNA construct Utworzenie konstruktu Fc-peptyd DNA AND I Introducing the construct into an expression vector Wprowadzenie konstruktu do wektora ekspresji AND I Transfecting the host cell with the vector Transfekowanie komórki gospodarza wektorem AND I Ekspresja wektora w komórce gospodarza ί Expression of the vector in the host cell of ί Establishment of Fc multimer in the host cell Utworzenie multimeru Fc w komórce gospodarza AND' I’ Isolation of Fc multimer from the host cell Wyodrębnienie multimeru Fc z komórki gospodarza PL 211 164 B1 PL 211 164 B1 415 415 416 416 PL 211 164 B1 PL 211 164 B1 FIG. 3A FIG. 3A Fc r FIG. 3B Fc _ A < Λ 1 1 pp 1 1 ... 1 _ ζ 1 1 pp 1 1 FIG. 3C Fc AND r Λ 1 1 pp And 1 L. And 1 sst 1 Fc r FIG. 3B Fc _ A < Λ 1 1 s s 1 1 ... 1 _ ζ 1 1 s s 1 1 FIG. 3C Fc A r Λ 1 1 s s I 1 L I 1 s s t 1 PL 211 164 B1 PL 211 164 B1 417 417 418 418 PL 211 164 B1 tBu Trt I I TBu Trt II Pbf and Pbf i FIG. 5 FIG. 5 NH-Dde NH-Dde JBu Jrt Pbf JBu Jrt Pbf Boc-IĘGPTLRQWLAARA-GGG-HN ^ CO-GGGG-ięGPTLRQWLAARA-OCH5-0 tBu Pbf Boc tBu pf ^ Boc Boc-IĘGPTLRQWLAARA-GGG-HN^CO-GGGG-ięGPTLRQWLAARA-OCH5-0 tBu Pbf Boc tBu pf^ Boc 2% H2NNH2/ NMP 2% H2NNH2/NMP Wang resin Żywica Wang NHj | Bu Trt NHj |Bu Trt Pbf and | Bu Jrt Pbf i |Bu Jrt T * T* Boc-IEGrTŁRQWLAARA-GGG-HN 00-GGGG-ięGPTŁRQWLAARA-OCHjtBu Pbf Boc (BrCH ^ Ohol tBu Pbf Boc Boc-IEGrTŁRQWLAARA-GGG-HN 00-GGGG-ięGPTŁRQWLAARA-OCHjtBu Pbf Boc (BrCH^Ohol tBu Pbf Boc Wang resin Żywica Wang Br ^ X tBu pt LQV tBu Pbf Boc Br^X tBu pt LQV tBu Pbf Boc Γ- I Tw Ϊ fBufrt PW Γ- ITin Ϊ fBufrt PW Boc-IĘGPTLRQWLAARA-GGG-HN CO-GGGG-I ^ GPTLRQWLAARA — OCHp ^ J tBu Pbf Boc Boc-IĘGPTLRQWLAARA-GGG-HN CO-GGGG-I^GPTLRQWLAARA—OCHp^J tBu Pbf Boc TFA I Br-Jt. TFA and Br-Jt. Alive ca Wang Żywi ca Wang H-IEGPTLRQWLAARA-GGG-HN CO-GGGG-IEGPTLRQWLAARA-OH H-IEGPTLRQWLAARA-GGG-HN CO-GGGG-IEGPTLRQWLAARA-OH Peptide I7b Peptyd I7b MeO " MeO” PEG 5000 pH8 PEG 5000 pH8 MeO- PEG 5000 MeO-PEG 5000 NH £ NH £ H-IEGPTLRQWLAARA-GGGHN CO-GGGG-IEGFTLRQWLAARA-OH H-IEGPTLRQWLAARA-GGGHN CO-GGGG-IEGFTLRQWLAARA-OH Peptide 19 Peptyd 19 PL 211 164 B1 PL 211 164 B1 419 tBu Trt I 419 tBu Trt I Pbf and Pbf i FIG. 6 FIG.6 Trt and Trt i tBu Trt I I tBu Trt II PM PM AND I H-IEGPTLRQWLAARA-GGGCGGGG-I ^ GPTLRQWLAARA-OCHr ^ tBu PbfBoc tBu PbfBoc H-IEGPTLRQWLAARA-GGGCGGGG-I^GPTLRQWLAARA-OCHr^ tBu PbfBoc tBu PbfBoc Wang resin Żywica Wang TFA TFA H-IEGPTLRQWLAARA-GGG-HN CO «GGGG-IEGPTLRQWLAARA-OH H-IEGPTLRQWLAARA-GGG-HN CO«GGGG-IEGPTLRQWLAARA-OH 18O peptide Peptyd 18 O MeOPEG 5000 with1 pH 8 MeOPEG 5000 z1 pH 8 MeO- PEG5000 -N 0 λ MeO- PEG5000 -N 0 λ H-IEGPTLRQWLAARA-GGG-HN CO-GGGG-IEGPTLRQWLAARA-OH H-IEGPTLRQWLAARA-GGG-HN CO-GGGG-IEGPTLRQWLAARA-OH Peptide 20 Peptyd 20 420 420 PL 211 164 B1 PL 211 164 B1 PL 211 164 B1 PL 211 164 B1 421 421 422 422 PL 211 164 B1 PL 211 164 B1 FIG. 9 FIG. 9 AND I TCTAGATTTGTTTTAACTAATTAAAGGAGGAATAACATATGATCGAAGGTCCGACTCTGC 1 ................ * ......... * ......... + ......... * ... ....... «about agatctaaacaaaattgattaatttcctccttattgtatactagcttccaggctgagacg miegptlr · gtcagtggctggctgctcgtgctggcggtggtggcggagggggtggcattgagggcccaa 61 ......... * ......... * ......... * ......... * ......... * ......... + 120 cagtcaccgaccgacgagcacgaccgccaccaccgcctcccccaccgtaactcccgggtt qwlaaraggggcgggiegpt TCTAGATTTGTTTTAACTAATTAAAGGAGGAATAACATATGATCGAAGGTCCGACTCTGC 1 ................*.........*.........+.........*.......... «o agatctaaacaaaattgattaatttcctccttattgtatactagcttccaggctgagacg miegptlr· gtcagtggctggctgctcgtgctggcggtggtggcggagggggtggcattgagggcccaa 61 .........*.........*.........*.........*.........*.........+ 120 cagtcaccgaccgacgagcacgaccgccaccaccgcctcccccaccgtaactcccgggtt qwlaaraggggcgggiegpt· cccttcgccaatggcttgcagcacgcgcagggggaggcggtgggcacaaaactcacacat 121 ......... + ......... + ........- + ................... + ......... + 180 gggaagcggttaccgaacgtcgtgcgcgtccccctccgccacccctgttttgagtgtgta 121 .........+.........+........- +...................+.........+ 180 gggaagcggttaccgaacgtcgtgcgcgtccccctccgccacccctgttttgagtgtgta LRQWLAARAGGGGGDSTHTC LRQWLAARAGGGGGDSTHTC· GTCCACCTTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTTTTCCTCTTCCCCCCAA GTCCACCTTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTTTTCCTCTTCCCCCCAA 1Θ1 ......... + ......... + ......... + · ......... * ---..... . + ......... + 240 1Θ1 .........+.........+.........+·.........*---......+.........+ 240 CAGGTGGAACGGGTCGTGGACTTGAGGACCCCCCTGGCAGTCAAAAGGAGAAGGGGGGTT CAGGTGGAACGGGTCGTGGACTTGAGGACCCCCCTGGCAGTCAAAAGGAGAAGGGGGGTT PPC PAPBLLGGP3VFLFPPKAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCCTGGTGGTGGACG PPC PAPBLLGGP3VFLFPPKAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCCTGGTGGTGGACG 241 .........+...................♦...................+.........+ 300 241 .........+...................♦...................+.........+ 300 TTGGGTTCCTGTGGGAGTACTAGAGGCCCTGGGGACTCCAGTGTACGCACCACCACCTGC TTGGGTTCCTGTGGGAGTACTAGAGGCCCTGGGGACTCCAGTGTACGCACCACCACCTGC PXDTLMISRTPEVTCVVVDVTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATA PXDTLMISRTPEVTCVVVDVTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATA