MX366164B

Gene expression profile algorithm and test for determining prognosis of prostate cancer.

Abstract

The present invention relates to molecular assays based on an algorithm that involves measuring the expression levels of the genes, or their co-expressed genes, of a biological sample obtained from a patient with prostate cancer. Genes can be grouped into subsets of functional genes to calculate a quantitative record useful for predicting a probability of a clinical outcome for a patient with prostate cancer.

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Expires 31 July 2034.

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12 claims: 11 independent, 1 dependent

  1. 1
    Habiéndose descrito la invención como antecede, se reclama como propiedad lo contenido en las siguientes 5 reivindicaciones:1. Un método para predecir una probabilidad de un resultado clínico para un paciente con cáncer de próstata, caracterizado porque comprende: (b) normalizar el nivel de los transcritos de ARN para obtener niveles de expresión de ARN normalizados;15 (c) calcular una puntuación de grupo andrógeno para el paciente a partir de los niveles de expresión de ARN normalizados;y (d) predecir la probabilidad de un resultado clínico para el paciente con base en la puntuación de grupo 20 andrógeno, en donde la expresión de ARN normalizada de cada uno de FAM13C, KLK2, AZGP1, y SRD5A2 se correlaciona con una probabilidad incrementada de un resultado clínico negativo.
  2. 2
    El método de conformidad con la reivindicación 1, caracterizado porque la puntuación de grupo andrógeno es 25 Puntuación Umbral de 0.634 x FAM13C + 1.079 x KLK2 + 0.642 x 172 AZGP1 + 0.997 x SRD5A2, en donde la puntuación Umbral SRD5A2 equivale a 5.5 si SRD5A2 es menor que 5.5 y equivale a SRD5A2 si SRD5A2 es 5.5 o mayor, y en donde los símbolos de gen en las ecuaciones representan los niveles de expresión normalizados de los transcritos de ARN de los genes respectivos.
  3. 3
    El método de conformidad con la reivindicación 1 ó 2, caracterizado porque los niveles de expresión de FAM13C, KLK2, AZGP1, y SRD5A2 se normalizan relativos con los niveles de expresión de ARFl, ATP5E, CLTC, GPSl y PGK1.
  4. 4
    El método de conformidad con la reivindicación 2 ó 3, caracterizado porque un incremento en la puntuación de grupo andrógeno se correlaciona con una probabilidad incrementada de un resultado clínico negativo.
  5. 5
    El método de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1-4, caracterizado porque el resultado clínico es el aumento de cáncer de próstata.
  6. 6
    El método de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1-4, caracterizado porque el resultado clínico es la reclasificación del cáncer de próstata.
  7. 7
    El método de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1-4, caracterizado porque el resultado clínico es la recurrencia de cáncer de próstata.
  8. 8
    El método de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1-4, caracterizado porque el resultado 173 clínico es enfermedad confinada no a órganos.
  9. 9
    El método de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1-4, caracterizado porque el resultado clínico es patología adversa. 5 10. El método de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1-9, caracterizado porque el nivel de los transcritos de ARN se determina mediante un método que comprende reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa. 11. El método de conformidad con cualquiera de las
  10. 10
    10 reivindicaciones 1-10, caracterizado porque además comprende crear un reporte que resume la probabilidad de un resultado clínico.
  11. 11
    12. El método de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 1-11, caracterizado porque la muestra
  12. 12
    15 biológica que contiene células cancerosas está fija, incrustada en parafina, o es reciente, o congelada.